Compleet 50%

Image Annotation WorkStation

210005

22/09/2020

Opdrachtgever

DASH UMCG

Omschrijving

Compleet 25%

Ontwerp en implementatie van een omgeving binnen de research workspace van het UMCG waarin data annotatie op een goede en veilige manier kan plaatsvinden.

Doelstelling

Compleet 25%

Doel is een flexibele veilige online omgeving te creëren die het mogelijk maakt om beelden te annoteren op verschillende locaties.

Aanleiding

Compleet 50%

Verkrijgen van annotaties is een van de grootste uitdagingen in deep learning projecten. Het vraagt vaak om het gecentraliseerd annoteren van data door experts. Standaard software levert niet altijd annotaties op in bruikbaar formaat. Directe aanleiding om dit project sneller uit te voeren is de Covid uitbraak waardoor studenten die annotaties verrichten thuis kwamen te zitten en niet door konden met hun project.

Resultaten

Compleet 90%
  • Resultaat is een werkende workspace onder de UMCG research workspace omgeving waarin met behulp van XNAT gekoppelde software annotaties op en aan beelden gemaakt kunnen worden die later gebruikt kunnen worden voor het trainen van deep learning modellen.
  • Op dit moment wordt door studenten bij DASH gewerkt aan de architectuur van deze omgeving, streven is om binnen deze studentprojecten tevens een pilot omgeving te bouwen.
  • Verkenning mogelijkheden met NVIDIA is onderdeel van het project
  • Mogelijk dat deze oplossing ook bijdraagt om een omgeving te creëren waar ziekenhuizen makkelijker bereid zullen zijn om data lokaal en veilig beschikbaar te stellen voor annotaties zonder dat de data hoeft te worden gecentraliseerd.

Financiering

Compleet 25%

dHealth project
Financiering in de toekomst vanuit projecten die gebruik maken van deze workspace.
Basis investering ligt bij UMCG/RUG voor de infrastructuur, gebruikte software is open-source (dus geen licentie kosten), UMCG/RUG zal gebruik doorbelasten.

Bereik

Compleet 75%
  • Doelgroep:
    • Onderzoekers of bedrijven die een dataset willen annoteren
  • Stakeholders, teams, domeinen, faculteiten, diensten
    • dHealthLab Annotatielab
    • DASH MLL
    • UMCG
  • Relatie met andere projecten en/of voorzieningen
    • Lopende studentprojecten

Randvoorwaarden

Compleet 25%

Gebruik XNAT en de daaraan te koppelen systemen.
Implementatie binnen research workspace UMCG

Deels afhankelijk van XNAT project binnen UMCG.

Partners dhealth
In samenwerking met: